广州市八医院捕获XBB等变异株，华大智造为新冠变异监测提供底层工具
随着1月8日起我国对新型冠状病毒实施“乙类乙管”，国内的新冠疫情防控进入了新阶段，抗疫工作的重心也...
2023-01-15广州市八医院捕获XBB等变异株，华大智造为新冠变异监测提供底层工具
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随着1月8日起我国对新型冠状病毒实施“乙类乙管”，国内的新冠疫情防控进入了新阶段，抗疫工作的重心也从“防感染”转到“保健康、防重症”。对于各级政府来讲，稳妥有序实施“乙类乙管”是一项复杂的系统工程，面临着新形势和新任务。
在这一背景下，国家疾控部门进一步完善新冠病毒变异监测的工作方案，确保人民群众的健康安全，在本土案例监测方面，每个省份都选择了部分的城市和医院作为监测哨点，对门诊病历、重症和死亡病例开展一定数量的新冠病毒感染病例的采样和序列测定。
广州医科大学附属市八医院(以下简称广州市八医院)作为“入境患者定点收治医院”，一直动态监测新冠病毒变异的趋势，以便能够及时动态掌握人群感染发病水平和变化趋势，科学研判和预测疫情规模、强度和流行时间，动态分析病毒株变异情况。
近日，广州市八医院基于华大智造的MGISEQ-2000基因测序仪、ATOPlex RNA多重PCR建库试剂盒套装V3.1以及MetargetCOVID软件的测序组合，在收治的境外输入新冠病毒感染者中检测出了BQ.1.25、XBB.1、XBB.2等奥密克戎亚型变异毒株。
测序报告显示测出BQ.1.25、XBB.1及XBB.2等变异毒株
据悉，华大智造MGISEQ-2000是一款灵活高效的测序平台，搭配2种通量的载片：大载片(FCL)和小载片(FCS)，可独立上机，单次运行数据产量可从55Gb到1,440Gb；ATOPlex RNA多重PCR建库试剂盒套装V3.1则采用328对混合引物(平均扩增178bp)来捕获新冠病毒全基因组序列信息，对于低浓度、易降解的样本友好、具有极高的灵敏度。再配合支持批量样本快速分析MGI MetargetCOVID软件，可实现对新冠病毒的准确分型。
通过华大智造MGISEQ-2000、ATOPlexV3.1及MetargetCOVID软件的测序组合，广州市八医院能够单次完成96*个新冠样本的测序工作，得到病毒序列全长覆盖率达到99%以上，测序效率高，测序结果质量优异。
事实上，早在2021年5月，华大智造就为广州市八医院提供新冠病毒测序工作提供工具支撑。仅在2021年5月21日至2021年6月18日不到1个月的时间里，该院就确诊出159例新冠Delta毒株病例。依托华大智造的ATOPlex技术平台和MGISEQ-2000测序仪的测序组合产品，广州市八医院联合广州医科大学附属第一医院等单位成功实现对新冠Delta病毒全基因组的测序、比对、分型和溯源。
“华大智造提供的国产高通量测序工具组合准确、高效、操作简便，为新冠病毒变异监测提供了强大的技术支撑。”广州医科大学附属市八医院传染病研究所主任李锋对于华大智造的测序工具组合表示了肯定。
作为国产测序仪龙头，华大智造致力于成为“生命科技核心工具缔造者”，其掌握的高通量测序技术在病原的监测和溯源以及公共卫生事件的应对中发挥着极其重要的作用。后续针对医疗机构、公共卫生机构开展新型冠状病毒感染疫情监测的需求，华大智造实时、全景、全生命周期的测序产品组合，将持续助力病毒变异监测工作，为新阶段下的防控工作贡献一份力量。
